160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31250 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 
113 aa  221  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2030  flagellar basal-body rod protein FlgB  80.53 
 
 
113 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2994  flagellar basal-body rod protein FlgB  70.54 
 
 
113 aa  156  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0981  flagellar basal-body rod protein FlgB  58.26 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  53.57 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  48.65 
 
 
125 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2350  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.83 
 
 
118 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.48 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.71 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0134  flagellar basal body rod protein  41.67 
 
 
111 aa  66.6  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.24 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.77 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  32 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.87 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.72 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  34.33 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.4 
 
 
117 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.78 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  28.93 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  32.26 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  32.26 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.26 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.2 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  32.26 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  32.26 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  32.26 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  32.26 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  32.26 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  32.26 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.53 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.19 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.74 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.48 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.63 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.59 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.62 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.51 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.82 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.76 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.69 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  29.27 
 
 
129 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  31.45 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.23 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0795  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.67 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.31 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.23 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  30.28 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.36 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  29.75 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.23 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.45 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  29.73 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  27.52 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  26.61 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  34.58 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  34.58 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  34.58 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  34.58 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2268  flagellar basal body protein  36.13 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  34.58 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1212  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.56 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.856418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  26.61 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.15 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  31.58 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.87 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  26.27 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  29.36 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.41 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.69 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2338  flagellar basal body rod protein FlgB  26.85 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  27.52 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.04 
 
 
133 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  31.33 
 
 
138 aa  47.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  31.48 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  31.48 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.07 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.17 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.53 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  30.25 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  33.01 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.15 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.24 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.4 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.15 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.33 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  25.69 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.03 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.07 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0706  flagellar basal body rod protein FlgB  52.63 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  30.84 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.28 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.61 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.61 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.1 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  26.67 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  33.63 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>