202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0407 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 
139 aa  286  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  70.07 
 
 
140 aa  213  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  64.75 
 
 
140 aa  202  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  63.77 
 
 
140 aa  188  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  56.64 
 
 
146 aa  180  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  56.52 
 
 
139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  55.8 
 
 
139 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.26 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.15 
 
 
136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  39.55 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.57 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  35.34 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  34.85 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.92 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  34.56 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  31.3 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  32.59 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004173  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.34 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.58 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  34.07 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01286  flagellar basal body rod protein FlgB  35.34 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  32.84 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.78 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.38 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  34.59 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.81 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.54 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.83 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.58 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.67 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.67 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  29.32 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  31.62 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  30.88 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  30.88 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  31.88 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  31.85 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.81 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1792  flagellar basal body rod protein FlgB  32.33 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  34.09 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.2 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.37 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.89 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  28.89 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  28.79 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  32.12 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.6 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.21 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  31.06 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  31.65 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0633  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.08 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.32 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.872289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.46 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  29.37 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  29.37 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.28 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  29.37 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.08 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  27.82 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3827  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.32 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.268467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.88 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  30.3 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.26 
 
 
165 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  30.16 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  30.16 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.93 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.87 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  34.65 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.17 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.71 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  30.23 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  30.71 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  30.71 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  30.71 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  30.71 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.37 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  30.71 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.07 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  28.35 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.21 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.87 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.85 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.89 
 
 
130 aa  60.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.5 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  30.3 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.47 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.97 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.97 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  27.78 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0263  lateral flagellar rod protein LfgB  26.32 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.68 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.93 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  28.15 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  25.62 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.69 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  28.69 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.69 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>