265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1776 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 
132 aa  268  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  50 
 
 
130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  46.09 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  50.38 
 
 
136 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  51.16 
 
 
133 aa  120  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.48 
 
 
133 aa  120  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.33 
 
 
134 aa  113  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.97 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.74 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.27 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.56 
 
 
131 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.75 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.75 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.47 
 
 
165 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  45.11 
 
 
135 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  44.27 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  49.6 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.19 
 
 
139 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  46.97 
 
 
137 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  46.97 
 
 
137 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  46.97 
 
 
137 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  43.28 
 
 
138 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.36 
 
 
135 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  45.38 
 
 
130 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  43.28 
 
 
138 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  43.28 
 
 
138 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  43.28 
 
 
138 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  43.28 
 
 
138 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  44.62 
 
 
130 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  46.56 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.59 
 
 
139 aa  107  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  44.36 
 
 
135 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  44.19 
 
 
138 aa  105  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.2 
 
 
135 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  44.19 
 
 
138 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.19 
 
 
138 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  41.98 
 
 
136 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  45.8 
 
 
138 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  44.19 
 
 
138 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  44.19 
 
 
138 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  39.39 
 
 
134 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.53 
 
 
134 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  44.19 
 
 
138 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  41.98 
 
 
136 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  44.19 
 
 
138 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  44.36 
 
 
135 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  44.19 
 
 
138 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  44.19 
 
 
138 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.27 
 
 
135 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.65 
 
 
124 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  44.36 
 
 
135 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  41.98 
 
 
136 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  41.98 
 
 
136 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  46.15 
 
 
137 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.09 
 
 
130 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.88 
 
 
128 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  44.88 
 
 
128 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  44.53 
 
 
135 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  39.23 
 
 
132 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  42.31 
 
 
132 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.18 
 
 
130 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  42.31 
 
 
132 aa  100  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.18 
 
 
134 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3827  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.51 
 
 
151 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.268467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.53 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  40.62 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.45 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  43.85 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.34 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  37.42 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  42.31 
 
 
134 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.54 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.872289  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  43.51 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3468  flagellar basal body rod protein FlgB  41.54 
 
 
116 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3971  flagellar basal body rod protein FlgB  41.54 
 
 
116 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  38.71 
 
 
164 aa  97.1  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.42 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2411  flagellar basal body rod protein FlgB  37.66 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3025  flagellar basal body rod protein FlgB  37.66 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0258442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  40.52 
 
 
163 aa  95.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.54 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  40.77 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  39.87 
 
 
163 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  40 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  39.87 
 
 
163 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  39.87 
 
 
163 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  36.36 
 
 
162 aa  94.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  40 
 
 
135 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  40 
 
 
135 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  39.87 
 
 
163 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  39.87 
 
 
163 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  40 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0263  lateral flagellar rod protein LfgB  36.22 
 
 
111 aa  94  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  39.87 
 
 
163 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.39 
 
 
133 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  40.77 
 
 
132 aa  93.6  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3044  flagellar basal body rod protein FlgB  37.01 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1906  flagellar basal body rod protein FlgB  40.16 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.179452 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3371  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.22 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  36.77 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>