188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2665 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
136 aa  283  5e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  79.41 
 
 
136 aa  230  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  65.44 
 
 
155 aa  205  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  58.82 
 
 
137 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  51.47 
 
 
136 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.56 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.59 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.39 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.09 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  30.95 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.95 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  30.95 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.2 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  30.95 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.39 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.65 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  30.95 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  30.95 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  30.95 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  30.95 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.25 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.6 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.68 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.61 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  29.46 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.46 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  33.09 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.6 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  35.65 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.08 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1906  flagellar basal body rod protein FlgB  27.54 
 
 
131 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.179452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.35 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  26.72 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  26.72 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  26.72 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.69 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  35.66 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.83 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  28.24 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  28.68 
 
 
138 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  28.24 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.74 
 
 
133 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  27.13 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.81 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  27.13 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  31.25 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  27.13 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  27.13 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  27.13 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.44 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.36 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.55 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.98 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.31 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.03 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.01 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.33 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  26.32 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.12 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.23 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  23.48 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.94 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.19 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  24.62 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01013  flagellar basal body rod protein FlgB  29.91 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648482  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.7 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0706  flagellar basal body rod protein FlgB  29.55 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.14 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06153  flagellar basal body rod protein FlgB  29.91 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000283374  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  24.62 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.91 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 
132 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.04 
 
 
134 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.92 
 
 
131 aa  50.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  25.6 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.03 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.28 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  27.2 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1696  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.36 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0764494  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  24.82 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.32 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  32.23 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.17 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  29.23 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  26.28 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  28.18 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  28.32 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.2 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.61 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  23.84 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.61 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.36 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.27 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  26.47 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0168653 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>