206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1195 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.27 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.26 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.04 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.26 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.42 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.17 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.53 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.64 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  35 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.96 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  34.53 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.94 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.98 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.29 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  31.16 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.12 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.85 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.33 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.1 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3827  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.48 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.268467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  32.61 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  28.15 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.77 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.09 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  33.09 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  31.11 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  30.43 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  33.09 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  33.09 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  33.09 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  31.62 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  33.09 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  33.09 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.14 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.872289  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  33.09 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  33.09 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  29.55 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.36 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.61 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  32.61 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  34.06 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  32.61 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.16 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  30.67 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.76 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  32.39 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.58 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  31.16 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.21 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.47 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  31.16 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  31.16 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  31.16 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  31.16 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.85 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.14 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  33.6 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  32.61 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  32.61 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.08 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  32.03 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  32.61 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  25.6 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2556  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.74 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.132303  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2460  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.74 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0465271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1792  flagellar basal body rod protein FlgB  30.47 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.88 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  27.48 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.34 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.23 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2338  flagellar basal body rod protein FlgB  30.47 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  29.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.34 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01013  flagellar basal body rod protein FlgB  35.34 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648482  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.77 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2935  flagellar basal body rod protein FlgB  32.62 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1397  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.14 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0111094  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2411  flagellar basal body rod protein FlgB  32.62 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3025  flagellar basal body rod protein FlgB  32.62 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0258442  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.77 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  25 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06153  flagellar basal body rod protein FlgB  35.34 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000283374  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  32.62 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3070  flagellar basal body rod protein FlgB  32.62 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  31.01 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  31.5 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>