238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3841 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 
139 aa  283  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  94.96 
 
 
139 aa  270  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  63.04 
 
 
140 aa  178  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  56.52 
 
 
139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  56.52 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  49.65 
 
 
146 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  52.17 
 
 
140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.27 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.85 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.24 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.88 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.68 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  33.82 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  33.58 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  34.07 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.9 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  35.34 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  36.09 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.61 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.53 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  32.59 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.38 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.29 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.5 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.61 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  29.63 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.85 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.94 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.07 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.62 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  32.09 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  34.33 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.872289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3827  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.268467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.43 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1696  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.71 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0764494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.52 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  31.2 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  33.58 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.34 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.3 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.89 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  35.2 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.07 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  32.06 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.56 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.82 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.15 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  36.57 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.2 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.77 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  31.85 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.81 
 
 
144 aa  67  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.85 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.54 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0633  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.85 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.87 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.82 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.01 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  31.4 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  30 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.35 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.23 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  32.8 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.61 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  33.08 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.59 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  31.97 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.01 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  34.65 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  29.75 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.71 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.71 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  32.52 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.8 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.4 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  32.59 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  29.75 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.97 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  28.93 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.48 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  28.93 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  31.06 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  28.93 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000740  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.06 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.53 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.792834 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.93 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  28.93 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  32.84 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.84 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2597  flagellar basal body rod protein FlgB  31.62 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>