202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3732 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
136 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  94.85 
 
 
136 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  94.12 
 
 
136 aa  267  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  94.89 
 
 
136 aa  261  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  82.35 
 
 
135 aa  231  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  80.15 
 
 
135 aa  228  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  78.68 
 
 
135 aa  224  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  74.26 
 
 
135 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  74.26 
 
 
135 aa  207  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  72.79 
 
 
135 aa  201  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  53.68 
 
 
130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  56.62 
 
 
132 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  54.01 
 
 
134 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  51.82 
 
 
132 aa  137  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  52.59 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  50 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  50.74 
 
 
132 aa  130  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  50 
 
 
136 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.76 
 
 
133 aa  130  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  47.45 
 
 
132 aa  130  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.79 
 
 
131 aa  127  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  50.71 
 
 
134 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  48.55 
 
 
135 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  48.55 
 
 
135 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  50 
 
 
134 aa  124  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  48.18 
 
 
132 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2338  flagellar basal body rod protein FlgB  46.72 
 
 
131 aa  122  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  44.53 
 
 
132 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  45.26 
 
 
132 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1792  flagellar basal body rod protein FlgB  48.18 
 
 
131 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.29 
 
 
134 aa  120  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2947  flagellar basal body rod protein FlgB  49.28 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004173  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.45 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3100  flagellar basal body rod protein FlgB  48.55 
 
 
134 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1416  flagellar basal body rod protein FlgB  48.55 
 
 
134 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.8 
 
 
139 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2962  flagellar basal body rod protein FlgB  48.55 
 
 
134 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.52567  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2597  flagellar basal body rod protein FlgB  47.83 
 
 
134 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01286  flagellar basal body rod protein FlgB  45.99 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  44.27 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  43.61 
 
 
138 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  44.85 
 
 
130 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  44.85 
 
 
130 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  43.61 
 
 
138 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  43.51 
 
 
138 aa  114  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  43.61 
 
 
138 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  43.61 
 
 
138 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  43.61 
 
 
138 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  43.94 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  42.75 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.91 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.37 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.13 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  43.51 
 
 
138 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.51 
 
 
138 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  43.51 
 
 
138 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  43.51 
 
 
138 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.8 
 
 
133 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  43.51 
 
 
138 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  43.51 
 
 
138 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  43.51 
 
 
138 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  43.51 
 
 
138 aa  111  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  43.51 
 
 
138 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.75 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  41.98 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  41.98 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  41.98 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  40.15 
 
 
136 aa  110  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.07 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.22 
 
 
117 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.792834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.62 
 
 
136 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  42.42 
 
 
128 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.42 
 
 
128 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.73 
 
 
144 aa  105  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3468  flagellar basal body rod protein FlgB  42.65 
 
 
116 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  39.53 
 
 
135 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3971  flagellar basal body rod protein FlgB  42.65 
 
 
116 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.98 
 
 
132 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0227  flagellar basal body rod protein FlgB  36.84 
 
 
148 aa  104  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.873509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  40.44 
 
 
116 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0075  flagellar basal body rod protein FlgB  40.44 
 
 
116 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04909  flagellar basal body rod protein FlgB  41.18 
 
 
120 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0719  flagellar basal body rod protein FlgB  34.81 
 
 
158 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.82 
 
 
165 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  38 
 
 
151 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000740  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.74 
 
 
120 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0639  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.88 
 
 
121 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  38 
 
 
151 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.22 
 
 
124 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  37.69 
 
 
134 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.67 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  38.52 
 
 
116 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4671  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.74 
 
 
122 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0128148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3578  flagellar basal-body rod protein FlgB  40 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3371  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.24 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0263  lateral flagellar rod protein LfgB  36.76 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.42 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.08 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.08 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.35 
 
 
135 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>