202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2720 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 128 aa  257  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.55 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.88 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  36.97 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.4 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.8 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.65 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.38 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.45 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.07 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  32.54 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.22 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.68 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  33.88 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.81 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.78 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.62 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.13 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.01 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.75 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.51 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.92 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.51 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.51 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.53 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.77 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.71 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  35 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.45 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.28 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6371  flagellar basal body rod protein FlgB  29.41 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.13 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  30.07 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.54 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.61 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2935  flagellar basal body rod protein FlgB  29.11 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3070  flagellar basal body rod protein FlgB  29.11 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  33.63 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.63 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  33.63 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  33.63 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  33.63 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3044  flagellar basal body rod protein FlgB  29.41 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2411  flagellar basal body rod protein FlgB  29.41 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  33.63 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3025  flagellar basal body rod protein FlgB  29.41 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0258442  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  31.4 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  33.63 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  33.63 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.47 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.2 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  30.2 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.78 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  30.2 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.43 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  30.2 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  30.2 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  30.2 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  30.2 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  30.2 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  33.63 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1696  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.77 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0764494  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.98 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.04 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.93 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  26.83 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  32.74 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  27.63 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  28.76 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.05 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.65 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.65 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  28.7 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.89 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  30.08 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.89 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.82 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.84 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0240  flagellar basal body rod protein FlgB  27.52 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  32.14 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  28.26 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  26.97 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  30.63 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  28.26 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  32.14 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  28.26 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  31.86 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  31.86 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  31.86 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3578  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.67 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  31.86 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.04 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>