178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1645 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 
122 aa  249  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.16 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.61 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  35.51 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.48 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.48 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  34.78 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.43 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0407  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.21 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.779306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.21 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  31.93 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.71 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.03 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.04 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  32.71 
 
 
129 aa  57.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.7 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.93 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  25 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.91 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  31.53 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0075  flagellar basal body rod protein FlgB  32.14 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  29.41 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  31.82 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.43 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  29.77 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.04 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.03 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  31.86 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1906  flagellar basal body rod protein FlgB  26.96 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.179452 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  30.7 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  30.25 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  32.43 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.74 
 
 
140 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.83 
 
 
152 aa  52  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  28.07 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  26.92 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0169  flagellar basal body rod protein FlgB  26.83 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3578  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.19 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  35 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 
134 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  28.23 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.53 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  30.43 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  27.78 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.89 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.78 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  40.45 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.89 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.78 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.71 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.46 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  27.97 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.06 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3971  flagellar basal body rod protein FlgB  28.44 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  27.2 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  35.71 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0693  flagellar basal body rod protein FlgB  32.67 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  26.61 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.97 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  27.03 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  27.03 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  29.06 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.32 
 
 
134 aa  48.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  26.28 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  27.14 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  28.23 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  34.58 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.93 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  27.13 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  27.42 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.7 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.83 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  29.91 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  29.91 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.48 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.93 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.33 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01013  flagellar basal body rod protein FlgB  25 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06153  flagellar basal body rod protein FlgB  25 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000283374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  27.82 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.97 
 
 
128 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  27.82 
 
 
138 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.11 
 
 
134 aa  47.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3468  flagellar basal body rod protein FlgB  27.52 
 
 
116 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1402  flagellar basal body rod protein FlgB  26.85 
 
 
143 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.521491  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.27 
 
 
137 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0553  flagellar basal body rod protein FlgB  26.85 
 
 
143 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.693265  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  26.96 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  29.25 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  28.95 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1065  flagellar basal body rod protein FlgB  25 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  35.37 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.03 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0058  flagellar basal body rod protein FlgB  29.09 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.372308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>