68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3656 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
126 aa  260  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  52.8 
 
 
126 aa  152  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  46.4 
 
 
126 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  43.08 
 
 
125 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  45.6 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  44.72 
 
 
129 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  44 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  43.65 
 
 
128 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  43.44 
 
 
129 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  43.44 
 
 
129 aa  110  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  41.6 
 
 
126 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  40.31 
 
 
130 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  40.31 
 
 
130 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  39.68 
 
 
127 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  42.4 
 
 
135 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  41.86 
 
 
130 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  34.92 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  36 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  34.91 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.07 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  34.81 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  32.54 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  33.82 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.65 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  37.5 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  32.28 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1763  flagellar basal body rod protein FlgB  33.62 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  28.35 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  31.54 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  32.98 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  31.09 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  33.02 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4524  flagellar basal body rod protein  45.45 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.996777  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  27.87 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1819  flagellar basal body rod protein FlgB  32.11 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  31.36 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.86 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  31.54 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  26.77 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1560  flagellar basal body rod protein FlgB  30.63 
 
 
135 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.12 
 
 
152 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1531  flagellar basal body rod protein FlgB  30.63 
 
 
135 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1520  flagellar basal body rod protein FlgB  30.63 
 
 
135 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1709  flagellar basal body rod protein FlgB  30.63 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.58 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.65 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1741  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  29.23 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  29.73 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  28.33 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1674  flagellar basal body rod protein FlgB  30.17 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1557  flagellar basal body rod protein FlgB  30.17 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.371547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3636  flagellar basal body rod protein FlgB  29.73 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.17 
 
 
133 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.28 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  25.76 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.52 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1356  flagellar basal body rod protein FlgB  31.3 
 
 
135 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  23.66 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  27.12 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  27.5 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.93 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.5 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  32 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.56 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>