106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3437 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 
139 aa  283  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  40.83 
 
 
126 aa  87  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  37.4 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  38.66 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.41 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  36.13 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  34.65 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  34.13 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  34.13 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  37.14 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  35.71 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  34.17 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  33.86 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  33.86 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  40.62 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  32.54 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  32.5 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  34.11 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.92 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  33.59 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  31.82 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.7 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  31.06 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  28.26 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  29.41 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.79 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  36.45 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  34.58 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  30.15 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  33.96 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  30.71 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.78 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  35.51 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  29.57 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  32.73 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  27.56 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  37.5 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  31.78 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.2 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  31.78 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.64 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  32.79 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  35.85 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.71 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.03 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  29.13 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.16 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.17 
 
 
133 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  32.32 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  23.24 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  31.91 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  31.67 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.15 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  28.57 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4524  flagellar basal body rod protein  44.44 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.996777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.41 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  31.78 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  33.94 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.41 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.92 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.84 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0693  flagellar basal body rod protein FlgB  31.11 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0058  flagellar basal body rod protein FlgB  32.22 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.372308  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  31.13 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.11 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.67 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.47 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.38 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  31.68 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  32.61 
 
 
132 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  32.99 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.57 
 
 
146 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.64 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.97 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  31.13 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  31.13 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  31.13 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  31.13 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  31.13 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  29.31 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  35.62 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.11 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.17 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  29.31 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  32.99 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  29.31 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.78 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>