172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3971 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3971  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
116 aa  240  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3468  flagellar basal body rod protein FlgB  99.14 
 
 
116 aa  238  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  78.45 
 
 
116 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  75 
 
 
116 aa  189  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0075  flagellar basal body rod protein FlgB  75 
 
 
116 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000740  flagellar basal-body rod protein FlgB  60.33 
 
 
120 aa  148  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04909  flagellar basal body rod protein FlgB  58.68 
 
 
120 aa  147  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3578  flagellar basal-body rod protein FlgB  54.7 
 
 
117 aa  137  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  52.46 
 
 
124 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0263  lateral flagellar rod protein LfgB  50 
 
 
111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3371  flagellar basal-body rod protein FlgB  50 
 
 
111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4671  flagellar basal-body rod protein FlgB  53.33 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0128148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  50.43 
 
 
117 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.792834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0639  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.76 
 
 
121 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0184  flagellar basal-body rod protein FlgB  50 
 
 
124 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  48.51 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  46.56 
 
 
132 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0227  flagellar basal body rod protein FlgB  39.86 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.873509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  47.76 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  45.04 
 
 
132 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  45.8 
 
 
132 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0719  flagellar basal body rod protein FlgB  37.34 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  44.03 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  45.86 
 
 
134 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  43.28 
 
 
135 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.96 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  43.51 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  44.03 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  44.03 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  44.36 
 
 
134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  42.22 
 
 
136 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  43.51 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  44.27 
 
 
132 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  42.65 
 
 
136 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.79 
 
 
135 aa  105  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  42.65 
 
 
136 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.85 
 
 
131 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  42.54 
 
 
135 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  42.65 
 
 
136 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  42.75 
 
 
132 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  41.22 
 
 
132 aa  103  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.11 
 
 
134 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  43.61 
 
 
134 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.52 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.86 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2597  flagellar basal body rod protein FlgB  42.54 
 
 
134 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2947  flagellar basal body rod protein FlgB  41.35 
 
 
134 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1416  flagellar basal body rod protein FlgB  42.11 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2962  flagellar basal body rod protein FlgB  42.11 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.52567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3100  flagellar basal body rod protein FlgB  42.11 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.54 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.55 
 
 
135 aa  97.1  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.86 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  40.31 
 
 
130 aa  94.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  39.53 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.85 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.76 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.61 
 
 
133 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  40 
 
 
130 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  40 
 
 
128 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  40 
 
 
128 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.46 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2338  flagellar basal body rod protein FlgB  38.46 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.28 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  34.35 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.5 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  33.82 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  33.58 
 
 
135 aa  84.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.35 
 
 
139 aa  84.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.88 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1906  flagellar basal body rod protein FlgB  38.71 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.179452 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  32.06 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  32.06 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004173  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.69 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  34.62 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1792  flagellar basal body rod protein FlgB  33.85 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  32.06 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  36.15 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  32.06 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  34.62 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  32.06 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.94 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.85 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.92 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  34.09 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.09 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  34.09 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  34.09 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  34.09 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  34.09 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  34.09 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  34.09 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  34.09 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01286  flagellar basal body rod protein FlgB  36.92 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.08 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>