199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004173 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004173  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01286  flagellar basal body rod protein FlgB  97.71 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1792  flagellar basal body rod protein FlgB  83.97 
 
 		 131 aa  238  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2338  flagellar basal body rod protein FlgB  80.15 
 
 		 131 aa  224  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  52.27 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  54.55 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  54.96 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  54.96 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  49.24 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  50.76 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.69 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  50.76 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3100  flagellar basal body rod protein FlgB  45.14 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1416  flagellar basal body rod protein FlgB  45.14 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2962  flagellar basal body rod protein FlgB  45.14 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.52567  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  47.79 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  47.79 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.92 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2947  flagellar basal body rod protein FlgB  50.74 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2597  flagellar basal body rod protein FlgB  51.49 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  44.44 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  43.06 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.73 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  48.12 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  47.45 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  47.06 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  47.45 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  47.45 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.62 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  47.06 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  47.45 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.62 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  45.59 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  44.85 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  44.12 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  43.38 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.38 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.18 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.18 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.81 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  39.71 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  39.71 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  39.71 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  39.42 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  38.69 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  41.22 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  41.22 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  39.1 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  39.1 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  39.1 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  39.1 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  39.1 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.41 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.71 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  39.71 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.76 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  38.97 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  38.24 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.75 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.18 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  37.23 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.23 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  37.23 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  37.23 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  37.23 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  37.23 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  37.23 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  37.23 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  37.23 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0263  lateral flagellar rod protein LfgB  36.64 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3371  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.64 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.84 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0639  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.64 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  39.84 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.15 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.792834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.3 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  38.17 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000740  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.46 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.17 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.17 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0075  flagellar basal body rod protein FlgB  39.69 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0227  flagellar basal body rod protein FlgB  33.56 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.873509 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  40.15 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.52 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.64 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04909  flagellar basal body rod protein FlgB  35.38 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0719  flagellar basal body rod protein FlgB  32.08 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3971  flagellar basal body rod protein FlgB  37.69 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3468  flagellar basal body rod protein FlgB  36.15 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.64 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0069  flagellar basal body rod protein FlgB  40.15 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  34 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  34 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.46 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.78 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3827  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.09 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.268467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.09 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.872289  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.24 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.51 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.51 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>