67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0795 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0795  flagellar basal body rod protein  100 
 
 
112 aa  228  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.75 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.01 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  28 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  28 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.4 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  29.69 
 
 
138 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.3 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.05 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.52 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  32.38 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.23 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.46 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.92 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  29.84 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0981  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.65 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2994  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.41 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2350  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.29 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.8 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0134  flagellar basal body rod protein  26.36 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.86 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.95 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.59 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0706  flagellar basal body rod protein FlgB  35.48 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3025  flagellar basal body rod protein FlgB  32.1 
 
 
162 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0258442  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2411  flagellar basal body rod protein FlgB  32.1 
 
 
162 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  50 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.292861 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.83 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  23.26 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.55 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.19 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  28.18 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.67 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.67 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2030  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.43 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3070  flagellar basal body rod protein FlgB  32.1 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.91 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2935  flagellar basal body rod protein FlgB  32.1 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0693  flagellar basal body rod protein FlgB  35.71 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3044  flagellar basal body rod protein FlgB  31.65 
 
 
162 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  30.12 
 
 
164 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.7 
 
 
130 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  32.1 
 
 
162 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.78 
 
 
144 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  25.2 
 
 
132 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  27.42 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.9 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.46 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.55 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  25 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  31.3 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3636  flagellar basal body rod protein FlgB  25.66 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6371  flagellar basal body rod protein FlgB  34.25 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232984  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  47.5 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  32.93 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  32.93 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  32.93 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  47.5 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  32.93 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  41.38 
 
 
246 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  32.93 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.71 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>