116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2350 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2350  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 118 aa  236  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0981  flagellar basal-body rod protein FlgB  52.59 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.83 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2030  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.83 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.62 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  46.3 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2994  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.66 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140611 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.57 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.67 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.67 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.71 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.55 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.69 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.2 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.81 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  30.28 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.03 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  31.97 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.29 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  29.85 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  31.97 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0134  flagellar basal body rod protein  35.4 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.97 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  31.97 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  31.97 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  31.97 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  31.97 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  31.97 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  31.62 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  29.63 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.56 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.84 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.31 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  29.75 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.77 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1212  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.82 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.856418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.9 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.45 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.4 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.93 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  28.46 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  28.46 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  28.46 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.09 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.45 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  30.33 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.73 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  29.84 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.84 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.43 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  30 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.5 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  30.36 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  30.33 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0633  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.63 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  25.98 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.78 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.4 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  27.64 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.74 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.94 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0693  flagellar basal body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04909  flagellar basal body rod protein FlgB  30.63 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.67 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.37 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0795  flagellar basal body rod protein  29.29 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.35 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0706  flagellar basal body rod protein FlgB  31.3 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  28.18 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000740  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.93 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.5 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  28.32 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  27 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  29.75 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0058  flagellar basal body rod protein FlgB  27.91 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.372308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  27.93 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  43.55 
 
 		 750 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  44.26 
 
 		 408 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.03 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  27.59 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  40 
 
 		 856 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.09 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.46 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  28.7 
 
 		 129 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.65 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  41.94 
 
 		 623 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.19 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.91 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>