163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2030 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2030  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 113 aa  227  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31250  flagellar basal-body rod protein FlgB  80.53 
 
 		 113 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2994  flagellar basal-body rod protein FlgB  69.91 
 
 		 113 aa  164  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0981  flagellar basal-body rod protein FlgB  57.89 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  50 
 
 		 116 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  49.55 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2350  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.83 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.25 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.96 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.78 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.61 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.48 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.01 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0035  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.63 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  29.27 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.01 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  32.33 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.9 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  31.9 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  31.9 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.96 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0134  flagellar basal body rod protein  34.58 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.9 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  31.9 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  31.9 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  31.9 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  31.9 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  31.9 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  31.9 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1684  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.89 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.151611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.86 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.85 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.15 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  28.83 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  27.93 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.31 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.36 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  29.51 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1224  flagellar basal body rod protein FlgB  29.51 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1224  flagellar basal body rod protein FlgB  29.51 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.83 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0639  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.31 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  25.62 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.13 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.69 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  32.38 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  27.05 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  25.66 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  27.05 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.41 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  27.48 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.36 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.6 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  28 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  26.72 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  26.72 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1212  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.56 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.856418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.46 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6142  flagellar basal body protein FlgB  28.71 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  28.1 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.27 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.44 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  28 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3087  flagellar basal body rod protein FlgB  26.13 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.2 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  29.41 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  27.43 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.71 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2720  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.83 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.440795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  26.96 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4420  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.56 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  26.36 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0333  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.3 
 
 		 261 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  35.4 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  26.45 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3229  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.07 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  26.45 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  26.45 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.39 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2278  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.68 
 
 		 395 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3371  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.18 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  23.65 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  25.2 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.14 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.43 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.79 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  25.83 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3070  flagellar basal body rod protein FlgB  36.73 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2268  flagellar basal body protein  30.77 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.17 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  23.93 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  26.71 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>