24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3229 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3229  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0472  hypothetical protein  43.59 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0366232 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1322  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.06 
 
 		 136 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2958  flagellar basal-body rod protein, putative  39.23 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1767  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.38 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.1 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0981  flagellar basal-body rod protein FlgB  51.35 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2030  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.07 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.17 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  42.86 
 
 		 433 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  40.43 
 
 		 411 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  42.86 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.22 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3295  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.25 
 
 		 296 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0911  putative flagellar basal-body rod protein (flgC)  37.5 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  40.48 
 
 		 418 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  40.48 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.1 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2386  hypothetical protein  51.43 
 
 		 266 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3435  hypothetical protein  34.88 
 
 		 259 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  29.09 
 
 		 856 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1388  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.47 
 
 		 134 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2350  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.34 
 
 		 118 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>