207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6142 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6142  flagellar basal body protein FlgB  100 
 
 		 140 aa  284  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5971  flagellar basal-body rod protein FlgB  72.86 
 
 		 140 aa  215  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201131  normal  0.0194756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1755  flagellar basal-body rod protein FlgB  72.86 
 
 		 140 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.28549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  53.28 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  50 
 
 		 137 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.72 
 
 		 133 aa  113  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  59.05 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  48.33 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.97 
 
 		 139 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.34 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  46.34 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  46.34 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  46.34 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  46.34 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  46.34 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  46.34 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  47.11 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  48.33 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  50 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  45.53 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  46.28 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  45.53 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.14 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.19 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.79 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  45.45 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  51.43 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  45.45 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  45.45 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  45.45 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  45.45 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  45.45 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  42.15 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  42.15 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  42.15 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  42.98 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  44.44 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  50.48 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  43.22 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0083  flagellar proximal rod protein FlgB  51.43 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  51.43 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.45 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.45 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.72 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  44.35 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1672  flagellar basal-body rod protein FlgB  49.52 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.23 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.5 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  49.04 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1464  flagellar basal body rod protein FlgB  43.33 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1719  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.84 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3732  flagellar basal body rod protein FlgB  43.33 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4391  flagellar basal body rod protein FlgB  43.33 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  39.29 
 
 		 163 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4300  flagellar basal body rod protein FlgB  41.53 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  39.29 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  43.33 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.87 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  39.29 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  47.22 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  39.29 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  39.29 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  39.29 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50480  flagellar basal body rod protein FlgB  40.68 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168653 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  39.29 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  42.86 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  36.73 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.67 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0240  flagellar basal body rod protein FlgB  37.14 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02928  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.27 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742693  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.11 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.99 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1303  flagellar basal body rod protein FlgB  37.1 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3481  flagellar basal body rod protein FlgB  38.02 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0227  flagellar basal body rod protein FlgB  34.13 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.873509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.02 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01286  flagellar basal body rod protein FlgB  35.59 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004173  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.44 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2948  flagellar basal body rod protein FlgB  35.21 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.41 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.71 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0639  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.94 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  34.04 
 
 		 162 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.5 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  38.14 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6371  flagellar basal body rod protein FlgB  34.75 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2338  flagellar basal body rod protein FlgB  36.67 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.66 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0719  flagellar basal body rod protein FlgB  33.82 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3070  flagellar basal body rod protein FlgB  35.46 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3371  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.64 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2318  flagellar basal body rod protein FlgB  38.14 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2935  flagellar basal body rod protein FlgB  35.46 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.529299 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1792  flagellar basal body rod protein FlgB  36.44 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2411  flagellar basal body rod protein FlgB  34.75 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3025  flagellar basal body rod protein FlgB  34.75 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0258442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0206  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.9 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.792834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1161  flagellar basal body rod protein FlgB  33.9 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0263  lateral flagellar rod protein LfgB  39.64 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>