86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3954 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3954  flagellar basal-body rod protein FlgB  100 
 
 		 158 aa  320  5e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  26.85 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  30.3 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.71 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.7 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  26.97 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0462  flagellar basal-body rod protein FlgB  22.44 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.99 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.21 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  35.44 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.06 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  27.41 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2525  flagellar basal-body rod protein FlgB  23.6 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.438663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.52 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  62.86 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  34.18 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  34.18 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  34.18 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  34.18 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  34.18 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  34.18 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2054  flagellar basal-body rod protein FlgB  23.18 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3115  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.34 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.34 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.5 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  44.93 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  42 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  32.91 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  27.48 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.81 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  27.48 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0693  flagellar basal body rod protein FlgB  27.52 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  32.91 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4524  flagellar basal body rod protein  28.07 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.996777  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  42.86 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  27.66 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  25.52 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  28.06 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  28.06 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.15 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  28.06 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  28.06 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  28.06 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.68 
 
 		 133 aa  44.3  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  46.51 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  55.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  52.94 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  55.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  55.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  55.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  55.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0706  flagellar basal body rod protein FlgB  27.34 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  52.5 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  27.07 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  55.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  55.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  27.07 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  52.94 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  27.07 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  55.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  55.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  29.77 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.14 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3026  flagellar basal body rod protein FlgB  24.63 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.86 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.18 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  43.48 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.86 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3100  flagellar basal-body rod protein FlgB  25 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0399315  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0653  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.32 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  43.48 
 
 		 131 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2213  GTP-binding protein LepA  59.38 
 
 		 134 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.53 
 
 		 127 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  50 
 
 		 129 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  44.68 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  41.79 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.68 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  26.87 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  42.86 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.25 
 
 		 118 aa  41.2  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  41.67 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  25.17 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0240  flagellar basal body rod protein FlgB  44.19 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0058  flagellar basal body rod protein FlgB  42.86 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.372308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  21.94 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>