60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2503 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  48.1 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  45 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  35.44 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  36.71 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  34.15 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.74 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  35.44 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  35.44 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  37.5 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  40.74 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  36.59 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  35.44 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  35.44 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  37.97 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  40.74 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  34.18 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  40.43 
 
 		 251 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  36.54 
 
 		 264 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  30.43 
 
 		 253 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  38.3 
 
 		 247 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0408  thiamineS protein  34.67 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  31.76 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  32.91 
 
 		 74 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  28.99 
 
 		 251 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  40.43 
 
 		 251 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  35.44 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  31.76 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  32.1 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  32.1 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  37.5 
 
 		 254 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  29.17 
 
 		 251 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  29.17 
 
 		 251 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  30.68 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  26.58 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  35.44 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  31.4 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  29.17 
 
 		 251 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  32.91 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  38.3 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  28.38 
 
 		 251 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1701  thiamineS protein  33.96 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00127323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  37.74 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  30.12 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2579  hypothetical protein  32.14 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0958995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  47.62 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2502  thiamineS protein  45.24 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00382478  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3054  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0149  hypothetical protein  45.24 
 
 		 247 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  31.25 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0147  hypothetical protein  45.24 
 
 		 247 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  28.77 
 
 		 267 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  28.57 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.37 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.98 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2151  thiamineS protein  32.91 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.29 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1295  thiamineS protein  31.03 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1954  hypothetical protein  35.14 
 
 		 112 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>