19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1591 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  39.51 
 
 
74 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  37.5 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  34.62 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  35.8 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  34.18 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  35.06 
 
 
75 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  35.06 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.66 
 
 
74 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  25.97 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  36.36 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  33.77 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  35.8 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  29.87 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  36.36 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3287  hypothetical protein  38 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  29.87 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0973  hypothetical protein  36.73 
 
 
95 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  33.77 
 
 
74 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>