30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0889 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  67.57 
 
 		 74 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  55.41 
 
 		 74 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  56.76 
 
 		 74 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  54.05 
 
 		 74 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  51.35 
 
 		 74 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  51.39 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  44.59 
 
 		 74 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.95 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  41.33 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  40.54 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  40.54 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2841  thiamineS protein  39.19 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  35.53 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  35.53 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  41.67 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  34.18 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  38.67 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  32.1 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  29.17 
 
 		 74 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  30 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  36.36 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0111  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.25 
 
 		 235 aa  43.9  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129996  normal  0.207876 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  37.74 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  29.11 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  29.87 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.91 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  28.41 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  27.16 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  32.43 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>