27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1044 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  100 
 
 		 74 aa  150  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  59.46 
 
 		 74 aa  90.1  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  59.46 
 
 		 74 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  54.05 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  48.65 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  50 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  48.65 
 
 		 74 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  50 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  54.17 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  47.3 
 
 		 74 aa  67  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  50 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  41.33 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  45.95 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2841  thiamineS protein  41.89 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  35.14 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  41.56 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  40.54 
 
 		 74 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  35.44 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  39.19 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  42 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  30.38 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  48.89 
 
 		 79 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  46.81 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  32.43 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  34.67 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1853  thiamineS protein  38.46 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.479134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0822  thiamineS protein  32.05 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000395067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>