39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1774 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  100 
 
 		 79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  39.24 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  44.3 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  39.24 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  39.24 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  40.51 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  39.24 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  39.24 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  34.18 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  34.18 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  37.97 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  38.75 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1295  thiamineS protein  33.33 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  37.97 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  32.05 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  30.38 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  35.06 
 
 		 73 aa  48.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  32.1 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.65 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  35.44 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3548  thiamineS protein  35.8 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000742651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  32.91 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1649  hypothetical protein  46.81 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00308547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  42 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  32.5 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2579  hypothetical protein  30.23 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0958995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  27.38 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  34.18 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  26.51 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  27.78 
 
 		 254 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  37.74 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  27.38 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  29.76 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0329  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.1 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00555526  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0973  hypothetical protein  44.23 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2151  thiamineS protein  29.33 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3287  hypothetical protein  44.23 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0408  thiamineS protein  40.43 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  32.18 
 
 		 84 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>