33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1283 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  189  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  42.5 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  39.24 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  41.56 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  36.71 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  40.74 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  39.24 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  41.77 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  43.48 
 
 
251 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  43.48 
 
 
251 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  43.48 
 
 
251 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  42.03 
 
 
247 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3548  thiamineS protein  35.8 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000742651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  30.77 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  38.89 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  42.03 
 
 
251 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  44.44 
 
 
251 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  30.38 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  37.68 
 
 
266 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  34.18 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  33.8 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  40.74 
 
 
264 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  37.68 
 
 
251 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1113  hypothetical protein  29.11 
 
 
76 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  32.39 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  37.5 
 
 
251 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  37.68 
 
 
253 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  32.14 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.78 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  31.25 
 
 
254 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  37.68 
 
 
251 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  31.76 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  38.78 
 
 
74 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>