34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2934 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  100 
 
 		 74 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  94.59 
 
 		 74 aa  138  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  71.62 
 
 		 74 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  56.76 
 
 		 74 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  54.05 
 
 		 74 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  52.7 
 
 		 74 aa  84.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  51.35 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  50 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.3 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  46.67 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2841  thiamineS protein  45.95 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  47.3 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  48.61 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  44.16 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  37.84 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  39.24 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  40.54 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  40.54 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  39.19 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  37.97 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  36 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  36.71 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2151  thiamineS protein  34.67 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  25.68 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  28.21 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  30.12 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  29.76 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  33.75 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  33.8 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01049  molybdopterin converting factor, small subunit  37.35 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.286152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  33.77 
 
 		 78 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  32.26 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  27.38 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  27.38 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>