25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3946 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  100 
 
 		 84 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  97.62 
 
 		 84 aa  167  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  70.24 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  67.86 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2579  hypothetical protein  61.9 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0958995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  60.71 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  53.57 
 
 		 85 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1295  thiamineS protein  40.48 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  34.52 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  34.52 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  31.76 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  30.95 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  28.57 
 
 		 82 aa  48.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  30.23 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  30.95 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  32.14 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  30.23 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.33 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2128  MoaD family protein  30.43 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  29.76 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  27.71 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  29.49 
 
 		 251 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  29.87 
 
 		 254 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0174  MoaD family protein  31.87 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.704451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  27.38 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>