41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2579 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2579  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0958995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  72.62 
 
 		 84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  70.24 
 
 		 84 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  61.9 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  61.9 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  65.48 
 
 		 84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  54.76 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1295  thiamineS protein  41.67 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  32.14 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  32.14 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  36.14 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  33.33 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  33.33 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  34.18 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  32.14 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  32.14 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  35.9 
 
 		 251 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  32.14 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  34.52 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.88 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  41.94 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  32.14 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  30.23 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  32.05 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  34.21 
 
 		 251 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4837  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  34.57 
 
 		 251 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  28.95 
 
 		 247 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4615  molybdopterin converting factor subunit 1  32.53 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4971  molybdopterin converting factor subunit 1  32.53 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.210514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  32.89 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  41.94 
 
 		 65 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  28.74 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4861  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.33 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>