31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1819 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2579  hypothetical protein  70.24 
 
 		 84 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0958995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  67.86 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  67.86 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  67.86 
 
 		 84 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  58.33 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  59.52 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1295  thiamineS protein  41.67 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  32.14 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  35.44 
 
 		 254 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  33.73 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  35.06 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  33.33 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  34.62 
 
 		 251 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  32.1 
 
 		 251 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  32.14 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  32.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  35 
 
 		 251 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  30.95 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  34.62 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  31.65 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  31.65 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  31.65 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  31.65 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  32.5 
 
 		 253 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  28.57 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  28.57 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  29.76 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  32.18 
 
 		 79 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>