43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2809 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  100 
 
 
85 aa  174  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  59.52 
 
 
84 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2579  hypothetical protein  54.76 
 
 
84 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0958995  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  50 
 
 
84 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  53.57 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  51.19 
 
 
84 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  53.57 
 
 
84 aa  92.8  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1295  thiamineS protein  42.05 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  29.76 
 
 
82 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  31.33 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  30.95 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  32.05 
 
 
254 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  32.53 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  29.27 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  40.32 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  30.12 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  38.71 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  32 
 
 
266 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  26.51 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  30.12 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 
65 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1315  thiamineS protein  31.58 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.538156  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  32.14 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  30.12 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  29.87 
 
 
251 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4347  thiamineS  30.34 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.022503  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  29.33 
 
 
264 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  35.48 
 
 
65 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  28.92 
 
 
74 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1285  hypothetical protein  26.25 
 
 
244 aa  40  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>