29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2848 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  100 
 
 		 84 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  64.29 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2579  hypothetical protein  65.48 
 
 		 84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0958995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  58.33 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  61.9 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  60.71 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2809  thiamineS protein  50 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1295  thiamineS protein  42.86 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  32.56 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  32.53 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  29.76 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  29.76 
 
 		 78 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  33.33 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  30.38 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  28.57 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  30.68 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  29.76 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  34.48 
 
 		 267 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  32.14 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  30.26 
 
 		 251 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  27.38 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  30.26 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  28.92 
 
 		 73 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  28.95 
 
 		 264 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  28.41 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  26.19 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  26.19 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  31.76 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.95 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>