35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1194 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  100 
 
 		 74 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  67.57 
 
 		 81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  56.76 
 
 		 74 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  59.46 
 
 		 74 aa  90.1  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  56.76 
 
 		 74 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  54.05 
 
 		 74 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  52.7 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  51.35 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.65 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  51.35 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  43.24 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2841  thiamineS protein  43.24 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  50 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  42.67 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  36.71 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  35.44 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  42.86 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  37.21 
 
 		 84 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  42.11 
 
 		 74 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  39.24 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  39.47 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  37.84 
 
 		 74 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  33.33 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  42.62 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2579  hypothetical protein  32.14 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0958995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  35.44 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0111  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.97 
 
 		 235 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129996  normal  0.207876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1295  thiamineS protein  35.71 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  31.17 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3946  thiamineS protein  30.23 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  31.76 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  27.03 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  31.08 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  31.88 
 
 		 254 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3295  thiamineS protein  29.07 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>