26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1351 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  100 
 
 		 74 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  94.59 
 
 		 74 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  72.97 
 
 		 74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  52.7 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  54.05 
 
 		 74 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  51.35 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  51.39 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  48.65 
 
 		 74 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.95 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2841  thiamineS protein  45.83 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  45.33 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  46.58 
 
 		 73 aa  67  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  45.95 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  44.16 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  40.54 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  37.97 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  35.14 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  37.84 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  25.68 
 
 		 74 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  36.49 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  35.44 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  33.33 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  39.62 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  32.39 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  34.62 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2151  thiamineS protein  33.96 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>