34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2422 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  100 
 
 		 74 aa  150  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  71.62 
 
 		 74 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  72.97 
 
 		 74 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  59.46 
 
 		 74 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  56.76 
 
 		 74 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  56.76 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  52.7 
 
 		 74 aa  84.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  51.35 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1700  thiamineS protein  46.67 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  50 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  48.65 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2841  thiamineS protein  45.95 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  47.22 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  45.45 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  39.24 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  39.19 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  37.84 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  36.49 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  36.25 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  41.67 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.06 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  35.14 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  32.1 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  32.91 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  41.18 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  31.71 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  36.36 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  27.03 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  32.1 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  35.11 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0975  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.75 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1089  thiamineS protein  33.75 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  38.78 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1853  thiamineS protein  35.06 
 
 		 75 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.479134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>