195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1089 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0975  molybdopterin converting factor, subunit 1  100 
 
 		 80 aa  157  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1089  thiamineS protein  100 
 
 		 80 aa  157  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.34 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.84 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  44.58 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.91 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  45.78 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02951  molybdopterin synthase small subunit  47.06 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  48.19 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1515  molybdopterin synthase small subunit  48.19 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0090  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.320274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.43 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0547  molybdopterin synthase small subunit  49.4 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.51 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4637  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1879  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11270  Molybdopterin converting factor, small subunit  42.68 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4790  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000520563  hitchhiker  0.000000143296 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.12 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0111  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.04 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129996  normal  0.207876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  48.19 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  45.78 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  45.78 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  47.56 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  45.78 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  45.78 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.67 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002957  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  47.13 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1276  molybdopterin synthase small subunit  45.24 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116417  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  47.56 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.57 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  47.56 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  47.56 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3054  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  42.68 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1029  molybdopterin synthase small subunit  38.27 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.67 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.56 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  47.56 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.71 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  47.56 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  47.56 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  44.58 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.71 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2146  thiamineS  37.35 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1853  thiamineS protein  46.25 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.479134  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.68 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0049  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.038517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  46.34 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0965  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.68 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2481  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.97 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0329  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00555526  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2168  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.02 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0221  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.71 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  40.24 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.35 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2078  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  37.8 
 
 		 262 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00767498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0084  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.46 
 
 		 82 aa  52  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.5 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2280  molydbenum cofactor biosynthesis protein D  42.17 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  38.55 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.44 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  41.46 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  41.46 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  41.46 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>