210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1515 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1515  molybdopterin synthase small subunit  100 
 
 
81 aa  165  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  92.59 
 
 
81 aa  157  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  80.25 
 
 
81 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  80.25 
 
 
81 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  75.31 
 
 
81 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  72.84 
 
 
81 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  72.84 
 
 
81 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  72.84 
 
 
81 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  72.84 
 
 
81 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  72.84 
 
 
81 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  72.84 
 
 
81 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  72.84 
 
 
81 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  72.84 
 
 
81 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  70.37 
 
 
81 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  70.37 
 
 
81 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  70.37 
 
 
81 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  69.14 
 
 
81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  69.14 
 
 
81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  69.14 
 
 
81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  69.14 
 
 
81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  69.14 
 
 
81 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  69.14 
 
 
81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1276  molybdopterin synthase small subunit  65.43 
 
 
81 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116417  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0547  molybdopterin synthase small subunit  67.9 
 
 
81 aa  110  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1029  molybdopterin synthase small subunit  62.96 
 
 
81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1879  molybdopterin synthase small subunit  58.02 
 
 
81 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002957  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  62.35 
 
 
85 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02951  molybdopterin synthase small subunit  60 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  59.04 
 
 
83 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.63 
 
 
83 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.63 
 
 
83 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.63 
 
 
83 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.63 
 
 
83 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.63 
 
 
83 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 
83 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  54.22 
 
 
83 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4637  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.56 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  54.22 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  54.22 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  54.22 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  51.25 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.4 
 
 
83 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4790  molybdopterin converting factor, subunit 1  50.6 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000520563  hitchhiker  0.000000143296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  52.5 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0090  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.4 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.320274  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0900  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.25 
 
 
81 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0472678  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1293  molybdopterin converting factor, subunit 1  45 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4432  molybdopterin converting factor, subunit 1  45 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.15 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  49.4 
 
 
83 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2146  thiamineS  46.99 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4556  molybdopterin converting factor, subunit 1  45 
 
 
81 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.896791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13240  molybdopterin converting factor, small subunit  49.4 
 
 
83 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.494313  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1035  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.91 
 
 
80 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.964546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  52.38 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0084  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.22 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11270  Molybdopterin converting factor, small subunit  49.4 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0965  molybdopterin synthase subunit MoaD  47.5 
 
 
80 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2156  thiamineS  43.21 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0674186  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2168  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.12 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01049  molybdopterin converting factor, small subunit  46.91 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.286152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.91 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.19 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  41.46 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2078  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  44.58 
 
 
262 aa  64.3  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00767498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1853  thiamineS protein  43.75 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.479134  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1089  thiamineS protein  48.19 
 
 
80 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0975  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.19 
 
 
80 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.51 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2814  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0334  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.38 
 
 
233 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.86513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.74 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.9 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 
85 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  42.17 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0780  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.17 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>