188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1267 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  100 
 
 
85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  97.65 
 
 
85 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  77.65 
 
 
87 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  69.41 
 
 
85 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  67.06 
 
 
87 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  68.24 
 
 
85 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  68.24 
 
 
85 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  68.24 
 
 
85 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  65.88 
 
 
85 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  65.88 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  65.88 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  65.88 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  65.88 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  65.88 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  65.88 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  65.88 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  65.88 
 
 
85 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  65.88 
 
 
85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  64.71 
 
 
85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  63.53 
 
 
85 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  63.53 
 
 
85 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  62.35 
 
 
85 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  62.35 
 
 
85 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.76 
 
 
85 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.24 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1545  molybdopterin synthase subunit MoaD  51.16 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  47.06 
 
 
83 aa  73.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 
83 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 
83 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1714  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.51 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  41.18 
 
 
82 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.35 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1828  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
83 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5690  thiamineS protein  44.71 
 
 
85 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2227  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.18 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189001 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.24 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2146  thiamineS  42.17 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2814  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.96 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0903  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2194  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.82 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000704898  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0090  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.19 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.320274  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.53 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1555  molybdopterin converting factor subunit 1  37.65 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  46.99 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6448  thiamineS protein  43.53 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.19 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.19 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.19 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4790  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 
83 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000520563  hitchhiker  0.000000143296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.53 
 
 
85 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4637  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  46.99 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  34.94 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1515  molybdopterin synthase small subunit  45.78 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0449  molybdopterin converting factor subunit 1  52.17 
 
 
46 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000437006  normal  0.597553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6963  thiamine S  41.18 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.7 
 
 
86 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0547  molybdopterin synthase small subunit  46.99 
 
 
81 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2346  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.76 
 
 
88 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5403  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13240  molybdopterin converting factor, small subunit  40.96 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.494313  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5395  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0296578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  40.96 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2274  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
83 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  43.37 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3715  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
83 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263871  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.96 
 
 
81 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.29 
 
 
85 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.29 
 
 
85 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1155  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.65 
 
 
85 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.9 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  43.37 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2999  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111426  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1977  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.76 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1029  molybdopterin synthase small subunit  37.35 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  44.58 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  43.37 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3104  molybdopterin-converting factor subunit 1  36.47 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493028  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.29 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  44.58 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>