146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1155 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1155  molybdopterin converting factor, subunit 1  100 
 
 		 85 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  55.42 
 
 		 83 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.63 
 
 		 83 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  59.04 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5403  molybdopterin converting factor, subunit 1  57.83 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.42 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0903  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.63 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.01 
 
 		 83 aa  90.5  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  58.82 
 
 		 85 aa  90.5  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2654  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 		 83 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3102  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 		 86 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2999  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 		 83 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3715  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263871  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2346  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2876  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.81 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.4 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2274  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.81 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2814  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3632  molybdopterin synthase subunit MoaD  53.01 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220789 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1828  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0780  molybdopterin converting factor, subunit 1  50.6 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2733  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.831217  normal  0.0341849 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1084  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.91 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  50.63 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3104  molybdopterin-converting factor subunit 1  47.06 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1230  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1072  molybdopterin synthase subunit MoaD  51.81 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1555  molybdopterin converting factor subunit 1  44.71 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1714  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.84 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.19 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2861  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.81 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2341  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.81 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.53 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.71 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.71 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.71 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1977  molybdopterin synthase subunit MoaD  49.4 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.82 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  42.35 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  40 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.65 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.65 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6963  thiamine S  41.18 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.65 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5690  thiamineS protein  40 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6448  thiamineS protein  40 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.969277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.18 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0049  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.71 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.038517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.96 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.35 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  38.55 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  38.55 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2168  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.56 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1545  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.19 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  39.24 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  39.24 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  32.53 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5395  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.53 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0296578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  37.97 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1427  thiamineS  43.53 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6402  thiamineS protein  43.53 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7061  thiamineS protein  43.53 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4790  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000520563  hitchhiker  0.000000143296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  38.55 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  38.55 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  38.55 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  33.73 
 
 		 83 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  37.35 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  37.35 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>