39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0449 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0449  molybdopterin converting factor subunit 1  100 
 
 
46 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000437006  normal  0.597553 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  66.67 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  52.17 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  52.17 
 
 
85 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.33 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.33 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.33 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.33 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.33 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.33 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.33 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.33 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  52.17 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  51.11 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.33 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.33 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.11 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.89 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.67 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  51.11 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 
85 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.89 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.44 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1555  molybdopterin converting factor subunit 1  48.89 
 
 
85 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.18 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.67 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.91 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.53 
 
 
83 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.67 
 
 
83 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.53 
 
 
83 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.59 
 
 
83 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2654  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.19 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.48 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.11 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0903  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.21 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.53 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.53 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>