187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2021 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1545  molybdopterin synthase subunit MoaD  59.52 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  57.83 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2194  molybdopterin synthase subunit MoaD  55.42 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000704898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  55.42 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  57.83 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 		 83 aa  94.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  58.33 
 
 		 83 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  59.52 
 
 		 83 aa  91.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  58.82 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2227  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.81 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.47 
 
 		 87 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  57.65 
 
 		 85 aa  86.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  57.65 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  57.65 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  57.65 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  57.65 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  57.65 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  59.52 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  57.65 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.29 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.29 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.29 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.29 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.29 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.29 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.29 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.47 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.76 
 
 		 85 aa  83.6  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  54.12 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.81 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.12 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  51.76 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.24 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.34 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 		 85 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  48.24 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.53 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.53 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.53 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.44 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.78 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  50 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  48.15 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.17 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.91 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  46.91 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  48.78 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  46.91 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  46.91 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  48.78 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  46.91 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  47.56 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  47.56 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  47.56 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  45.24 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6963  thiamine S  44.71 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.05 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1828  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0090  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.86 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.320274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4729  MoaD family protein  47.62 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1155  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3104  molybdopterin-converting factor subunit 1  42.86 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5395  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0296578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.68 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.12 
 
 		 81 aa  60.1  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  43.37 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  46.43 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2146  thiamineS  41.67 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.37 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.37 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.37 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  44.05 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.53 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0975  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.12 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.17 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1879  molybdopterin synthase small subunit  42.68 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1089  thiamineS protein  45.12 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13240  molybdopterin converting factor, small subunit  44.58 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.494313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.68 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01049  molybdopterin converting factor, small subunit  42.86 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.286152  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  46.34 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  44.58 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  45.12 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5690  thiamineS protein  42.35 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0547  molybdopterin synthase small subunit  44.44 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  45.12 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4556  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896791 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>