146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0903 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0903  molybdopterin converting factor, subunit 1  100 
 
 
83 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  75.9 
 
 
83 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  74.7 
 
 
83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  75.9 
 
 
83 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  69.88 
 
 
83 aa  127  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  72.29 
 
 
83 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5403  molybdopterin converting factor, subunit 1  72.29 
 
 
83 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3715  molybdopterin converting factor, subunit 1  71.08 
 
 
83 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263871  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  69.88 
 
 
83 aa  123  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2999  molybdopterin converting factor, subunit 1  68.67 
 
 
83 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111426  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2876  molybdopterin converting factor, subunit 1  68.67 
 
 
83 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784142  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3102  molybdopterin converting factor, subunit 1  67.47 
 
 
86 aa  120  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2654  molybdopterin converting factor, subunit 1  68.67 
 
 
83 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1714  molybdopterin converting factor, subunit 1  63.86 
 
 
83 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2346  molybdopterin converting factor, subunit 1  61.45 
 
 
83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1555  molybdopterin converting factor subunit 1  55.42 
 
 
85 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  57.83 
 
 
83 aa  97.4  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0780  molybdopterin converting factor, subunit 1  61.45 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  57.83 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  57.83 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2814  molybdopterin synthase subunit MoaD  55.42 
 
 
83 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1155  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.63 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2274  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 
83 aa  90.5  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.42 
 
 
85 aa  90.1  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1084  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.66 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1230  molybdopterin converting factor, subunit 1  52.44 
 
 
84 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  54.22 
 
 
81 aa  87.8  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1828  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  54.22 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1977  molybdopterin synthase subunit MoaD  59.04 
 
 
83 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3104  molybdopterin-converting factor subunit 1  47.06 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493028  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3632  molybdopterin synthase subunit MoaD  49.4 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.37 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2733  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.19 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.831217  normal  0.0341849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2861  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1072  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  42.17 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
85 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2341  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12358  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.35 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.35 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.17 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0049  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.71 
 
 
85 aa  57  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.038517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.14 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.14 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4637  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.33 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1029  molybdopterin synthase small subunit  39.76 
 
 
81 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  39.76 
 
 
81 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  39.76 
 
 
81 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5395  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0296578 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  38.55 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  38.55 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6963  thiamine S  36.14 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1427  thiamineS  39.76 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6402  thiamineS protein  39.76 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7061  thiamineS protein  39.76 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262126  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1089  thiamineS protein  33.73 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  37.35 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  37.35 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0975  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  37.35 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  37.35 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2227  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.94 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2146  thiamineS  29.63 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  31.33 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  31.33 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1545  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.29 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.53 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.53 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>