160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1360 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  100 
 
 		 83 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  83.13 
 
 		 83 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  81.93 
 
 		 83 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  75.9 
 
 		 83 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  74.7 
 
 		 83 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0903  molybdopterin converting factor, subunit 1  75.9 
 
 		 83 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5403  molybdopterin converting factor, subunit 1  72.29 
 
 		 83 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  71.08 
 
 		 83 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2654  molybdopterin converting factor, subunit 1  71.08 
 
 		 83 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3715  molybdopterin converting factor, subunit 1  71.08 
 
 		 83 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3102  molybdopterin converting factor, subunit 1  66.27 
 
 		 86 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2999  molybdopterin converting factor, subunit 1  66.27 
 
 		 83 aa  114  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2876  molybdopterin converting factor, subunit 1  67.47 
 
 		 83 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2346  molybdopterin converting factor, subunit 1  61.45 
 
 		 83 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1714  molybdopterin converting factor, subunit 1  59.04 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  60.24 
 
 		 83 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2814  molybdopterin synthase subunit MoaD  56.63 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0780  molybdopterin converting factor, subunit 1  60.24 
 
 		 86 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1230  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.88 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1084  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.88 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1555  molybdopterin converting factor subunit 1  53.01 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1155  molybdopterin converting factor, subunit 1  59.04 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2274  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.22 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1828  molybdopterin converting factor, subunit 1  50.6 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.81 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.81 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  56.63 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3632  molybdopterin synthase subunit MoaD  54.22 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  50.6 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1072  molybdopterin synthase subunit MoaD  50.6 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1977  molybdopterin synthase subunit MoaD  59.04 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3104  molybdopterin-converting factor subunit 1  48.19 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2733  molybdopterin converting factor, subunit 1  50.6 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.831217  normal  0.0341849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.78 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2861  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.19 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2341  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 85 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  40.96 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.76 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.76 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.14 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.29 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  40.96 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  40.96 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  39.76 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1515  molybdopterin synthase small subunit  40.96 
 
 		 81 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1029  molybdopterin synthase small subunit  39.76 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  38.55 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  38.55 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  38.55 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7061  thiamineS protein  44.58 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  39.76 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6963  thiamine S  40.96 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1427  thiamineS  44.58 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5690  thiamineS protein  42.35 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6402  thiamineS protein  44.58 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  39.76 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5395  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0296578 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6448  thiamineS protein  42.35 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.969277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.35 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  38.55 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1089  thiamineS protein  39.76 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0975  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  38.55 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1545  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.05 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0049  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.038517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1276  molybdopterin synthase small subunit  39.76 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116417  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  40.96 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  40.96 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.73 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>