165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2341 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2341  molybdopterin converting factor, subunit 1  100 
 
 		 83 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3632  molybdopterin synthase subunit MoaD  72.84 
 
 		 81 aa  121  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1072  molybdopterin synthase subunit MoaD  72.84 
 
 		 82 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2733  molybdopterin converting factor, subunit 1  72.84 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.831217  normal  0.0341849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2861  molybdopterin converting factor, subunit 1  72.84 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3104  molybdopterin-converting factor subunit 1  67.47 
 
 		 83 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  60.49 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  51.81 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2346  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.01 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2654  molybdopterin converting factor, subunit 1  50.6 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.81 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5403  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.4 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  50.6 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2274  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3715  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.4 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263871  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0780  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.86 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1828  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1155  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1084  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3102  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.86 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1230  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.98 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2876  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1555  molybdopterin converting factor subunit 1  43.53 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2999  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  47.06 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2227  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.4 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1714  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0903  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.24 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2194  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.78 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000704898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.68 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.68 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.19 
 
 		 223 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.08 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2814  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.37 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1977  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  42.86 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0049  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.24 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.038517 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.24 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.8 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  40.74 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  40.74 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  40.74 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2168  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.33 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.86 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.51 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  42.86 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.35 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1035  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.5 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.964546 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  37.78 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.65 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1029  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0900  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.1 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0472678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1545  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.53 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02446  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.21 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1293  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.1 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  39.76 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4432  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.1 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  38.27 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2280  molydbenum cofactor biosynthesis protein D  40.74 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  38.27 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4556  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896791 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  38.27 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0948  thiamineS protein  41.98 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>