182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2194 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2194  molybdopterin synthase subunit MoaD  100 
 
 
83 aa  166  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000704898  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2227  molybdopterin converting factor, subunit 1  79.52 
 
 
83 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  68.67 
 
 
83 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  68.67 
 
 
83 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  68.67 
 
 
83 aa  110  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  65.06 
 
 
95 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  62.65 
 
 
91 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.42 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  56.63 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.63 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1545  molybdopterin synthase subunit MoaD  60 
 
 
84 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  50.59 
 
 
85 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 
85 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 
85 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 
85 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 
85 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 
85 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 
85 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 
85 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.24 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.24 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.06 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.06 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.88 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.06 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  52.94 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 
85 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 
85 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.71 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  46.51 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.53 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.76 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.1 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6963  thiamine S  47.06 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.53 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2341  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12358  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3104  molybdopterin-converting factor subunit 1  42.17 
 
 
83 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493028  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5690  thiamineS protein  44.71 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6448  thiamineS protein  44.71 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.96 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3632  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.57 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2861  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  43.37 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7061  thiamineS protein  45.88 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262126  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1427  thiamineS  47.06 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6402  thiamineS protein  47.06 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2733  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.21 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.831217  normal  0.0341849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1072  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.21 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.24 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5395  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0296578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.47 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1828  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.51 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2168  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.1 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.18 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  42.17 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2156  thiamineS  34.57 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0674186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.55 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  41.38 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  41.38 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  41.38 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1879  molybdopterin synthase small subunit  38.27 
 
 
81 aa  54.7  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1586  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.48 
 
 
82 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
217 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  43.37 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
217 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  43.37 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01049  molybdopterin converting factor, small subunit  40.48 
 
 
82 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.286152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  43.37 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  43.37 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
223 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.60051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  40.23 
 
 
83 aa  53.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.63 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.63 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  40 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  42.17 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  42.17 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  39.76 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  42.17 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4556  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.896791 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1276  molybdopterin synthase small subunit  39.51 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116417  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  42.17 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1293  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
82 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4432  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
81 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.59 
 
 
81 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.08 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.08 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.08 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.08 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.08 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13129  molybdenum cofactor biosynthesis protein D moaD1  41.18 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139551 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.44 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1714  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.18 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.157129 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>