167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1035 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1035  molybdopterin synthase subunit MoaD  100 
 
 		 80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.964546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11270  Molybdopterin converting factor, small subunit  79.27 
 
 		 82 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  73.42 
 
 		 81 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1293  molybdopterin converting factor, subunit 1  70.89 
 
 		 82 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4432  molybdopterin converting factor, subunit 1  70.89 
 
 		 81 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0900  molybdopterin converting factor, subunit 1  70.89 
 
 		 81 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0472678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13240  molybdopterin converting factor, small subunit  77.11 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.494313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  70.89 
 
 		 81 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4556  molybdopterin converting factor, subunit 1  69.62 
 
 		 81 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  75.9 
 
 		 83 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0965  molybdopterin synthase subunit MoaD  65.82 
 
 		 80 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  49.38 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  49.38 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  49.38 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.15 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  49.38 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  49.38 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  49.38 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  49.38 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  49.38 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  50.62 
 
 		 81 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  50.62 
 
 		 81 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  50.62 
 
 		 81 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  48.15 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2146  thiamineS  50.6 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  46.91 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1515  molybdopterin synthase small subunit  46.91 
 
 		 81 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.38 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1276  molybdopterin synthase small subunit  45.68 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.12 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.68 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1029  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1879  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002957  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  44.71 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  44.44 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.21 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  46.99 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0547  molybdopterin synthase small subunit  44.44 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01049  molybdopterin converting factor, small subunit  42.5 
 
 		 82 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.286152  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.9 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.19 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.68 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02951  molybdopterin synthase small subunit  42.35 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.15 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3054  molybdopterin converting factor, subunit 1  45 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.9 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0090  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.320274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.21 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4790  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000520563  hitchhiker  0.000000143296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.29 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.53 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.53 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0084  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.34 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.53 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2481  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0780  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.98 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  43.53 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2814  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1853  thiamineS protein  37.97 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.479134  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.17 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.74 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.74 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2168  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.68 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  43.37 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.77 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4637  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.59 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2341  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.5 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>