189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3104 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3104  molybdopterin-converting factor subunit 1  100 
 
 
83 aa  164  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493028  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1072  molybdopterin synthase subunit MoaD  76.54 
 
 
82 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2733  molybdopterin converting factor, subunit 1  74.07 
 
 
82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.831217  normal  0.0341849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2861  molybdopterin converting factor, subunit 1  74.07 
 
 
82 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3632  molybdopterin synthase subunit MoaD  72.84 
 
 
81 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2341  molybdopterin converting factor, subunit 1  67.47 
 
 
83 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12358  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  62.96 
 
 
81 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  53.01 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2274  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.41 
 
 
83 aa  86.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.24 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.24 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5403  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.4 
 
 
83 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  50.6 
 
 
83 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  50.6 
 
 
83 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2346  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 
83 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1714  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.19 
 
 
83 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1828  molybdopterin converting factor, subunit 1  50.6 
 
 
83 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.19 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1155  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.06 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2654  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0903  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.06 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0780  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1555  molybdopterin converting factor subunit 1  43.53 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3715  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263871  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2876  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784142  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1230  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.98 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.88 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3102  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2999  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111426  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1084  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.98 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.17 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.71 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.35 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  41.98 
 
 
87 aa  67  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.98 
 
 
87 aa  67  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2814  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.37 
 
 
83 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  44.44 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  44.44 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  44.44 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  44.44 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.21 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2227  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0049  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.46 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.038517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2194  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.17 
 
 
83 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000704898  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  39.76 
 
 
95 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  40 
 
 
87 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1977  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.65 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.65 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.67 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  41.98 
 
 
81 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.65 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.86 
 
 
83 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  41.98 
 
 
81 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  41.98 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.29 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.65 
 
 
85 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  41.98 
 
 
81 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.7 
 
 
82 aa  60.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  41.98 
 
 
81 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1879  molybdopterin synthase small subunit  35.8 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  35.29 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.37 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.29 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.29 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.29 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.47 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.24 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.12 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  37.35 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  41.67 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.14 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.14 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0948  thiamineS protein  41.98 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.14 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02446  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.51 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
83 aa  57.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.98 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1293  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.1 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4432  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.1 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.692978 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>