213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3054 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3054  molybdopterin converting factor, subunit 1  100 
 
 
77 aa  158  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.84 
 
 
77 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2481  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.7 
 
 
77 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1853  thiamineS protein  48.05 
 
 
75 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.479134  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  51.25 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.23 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.19 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.19 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2923  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
237 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253971  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1035  molybdopterin synthase subunit MoaD  45 
 
 
80 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.964546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4637  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.53 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.02 
 
 
83 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4399  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.12 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0335567  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.02 
 
 
83 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.02 
 
 
83 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3195  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
238 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4790  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.12 
 
 
83 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000520563  hitchhiker  0.000000143296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  46.34 
 
 
83 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.7 
 
 
86 aa  60.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4469  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.26 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.17 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0111  molybdopterin converting factor, subunit 1  45 
 
 
235 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129996  normal  0.207876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4615  molybdopterin converting factor subunit 1  40.26 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4971  molybdopterin converting factor subunit 1  40.26 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.210514  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.53 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13240  molybdopterin converting factor, small subunit  45.12 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.494313  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  41.86 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2001  MoaD family protein  40.74 
 
 
228 aa  58.2  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4837  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.96 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11270  Molybdopterin converting factor, small subunit  43.21 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4450  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  43.18 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.68 
 
 
88 aa  57.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0090  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.46 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.320274  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0084  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.65 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0405  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.26 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0334  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.51 
 
 
233 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.86513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0975  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0275  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.18 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3746  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.18 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1089  thiamineS protein  43.37 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0276  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.18 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0948  thiamineS protein  41.25 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  37.21 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4831  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.26 
 
 
77 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4861  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.96 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4451  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.96 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  43.21 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4855  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.96 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.21 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.02 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4550  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.96 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  36.05 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1586  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.04 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2136  molybdopterin synthase subunit MoaE / molybdopterin synthase subunit MoaD  37.04 
 
 
248 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  39.29 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  38.2 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0900  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.46 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0472678  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  39.29 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  44.44 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  44.44 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  44.44 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  39.29 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1515  molybdopterin synthase small subunit  44.44 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  38.82 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2057  molybdopterin synthase subunit MoaD / molybdopterin synthase subunit MoaE  35.8 
 
 
228 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5522  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.5 
 
 
216 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0221  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.75 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.918434 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.1 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  38.1 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  40.74 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  38.1 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  38.1 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1293  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202321  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2078  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  43.37 
 
 
262 aa  53.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00767498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.02 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4432  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.68 
 
 
81 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0649  MoaD family protein  34.57 
 
 
229 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.321088  hitchhiker  0.00441005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  38.1 
 
 
81 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0965  molybdopterin synthase subunit MoaD  41.98 
 
 
80 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2146  thiamineS  34.88 
 
 
83 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.09 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.7 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.45 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2168  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.63 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2368  MoaD family protein  35.8 
 
 
228 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.467874  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.91 
 
 
83 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.91 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.68 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.29 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.96 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  38.1 
 
 
81 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1889  MoaD family protein  33.33 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4729  MoaD family protein  39.76 
 
 
221 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554846  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.68 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>