23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2836 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  100 
 
 
74 aa  148  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  45.95 
 
 
74 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  47.37 
 
 
75 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  44.59 
 
 
74 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  44.3 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  36.71 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  40 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  39.19 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  35.06 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  37.66 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  39.24 
 
 
79 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0826  thiamineS protein  35.53 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000193313  hitchhiker  0.00000689197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  35.14 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  36.49 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  33.78 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  32.91 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  31.94 
 
 
73 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.44 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  31.08 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  32.43 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  31.08 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  32.43 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  32.43 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>