21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2318 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  100 
 
 
74 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1044  thiamine S  35.14 
 
 
74 aa  53.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000364009  hitchhiker  0.00000000250038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  31.08 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1591  hypothetical protein  36.36 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  25.68 
 
 
74 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  29.73 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0889  thiamineS protein  29.17 
 
 
81 aa  48.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  46 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1678  thiamineS protein  33.78 
 
 
74 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0455  molybdopterin converting factor, small subunit  29.73 
 
 
74 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  26.58 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  30.67 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  25.68 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  38.89 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2836  thiamineS protein  31.08 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  29.73 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1194  thiamineS protein  27.03 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1382  thiamineS protein  32.88 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2422  thiamineS protein  27.03 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2151  thiamineS protein  41.51 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1721  molybdopterin converting factor, small subunit  27.03 
 
 
74 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000404625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>