11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2151 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2151  thiamineS protein  100 
 
 
75 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  37.33 
 
 
75 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  33.33 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2934  thiamineS protein  34.67 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0822  thiamineS protein  32.89 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000395067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2318  thiamineS protein  41.51 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  36.71 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  29.33 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  32.91 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1351  thiamineS protein  33.96 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  33.33 
 
 
74 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>